Animações sobre temas de Bioquímica estrutural e metabólica

Doutor Pedro Silva

Professor Auxiliar, UniversidadeFernando Pessoa

Introdução à bioquímica metabólica

Para tirar o máximo proveito destas animações, é importante rodar e ampliar frequentemente as moléculas, a fim de se visualizar correctamente a três dimensões.

Para ver estas apresentações é necessário que o programa Chemscape Chimeesteja instalado no seu computador. O programa é gratuito e ocupa cerca de 2.0 MB. A comunicação deste programa com o Internet Explorer não é perfeita: é frequente uma mensagem de erro ao mudar de página, mas que não afecta o funcionamento do programa. Se eventualmente alguma estrutura não carregar correctamente, é suficiente fazer um "refresh" ou seleccionar a página directamente a partir do menu abaixo.

Um breve sumário do funcionamento do rato com Chime.

Animações disponíveis:

  • Hidratos de carbono

    Estrutura secundária de proteínas

  • α-hélice
  • Folha pregueada β paralela
  • Folha pregueada β anti-paralela

    • Hemoglobina

  • Desoxiemoglobina
  • Efeito da ligação ao O2 na geometria do hemo e da sua subunidade
  • Mudanças na estrutura quaternária devidas à oxigenação do hemo

    • Complexos de transferência electrónica da cadeia respiratória

  • NADH desidrogenase (complexo I)
  • Succinato desidrogenase (complexo II)
  • Citocromo bc1 (complexo III)
  • Citocromo c oxidase (complexo IV)
    • Um grande arquivo de apresentações encontra-se disponível no Molecular Visualization Resources Index.

    O código HTML das páginas das animações baseia-se nos moldes gentilmente disponibilizados por Eric Martz, da Universidade do Massachussets.

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